En la Bahía de Sechura se identificó un total de 50 fuentes contaminantes, según un informe realizado por la Comisión Multisectorial de la Bahía de Sechura, en la que participaron la Autoridad Nacional del Agua Jequetepeque Zarumilla y el Órgano Desconcentrado de Administración Local de Agua Medio y Bajo Piura-2016.
Entre las cuales podemos señalar: tres vertimientos industriales autorizados, cuatro vertimientos pesqueros sin autorización, un vertimiento industrial no autorizado, dos vertimientos domésticos sin autorización, dos grifos de abastecimiento de combustible, dos reúsos sin autorización ( Municipalidad de Sechura y desembarcadero artesanal de la asociación frente de pescadores acuicultores artesanales de Puerto Rico), un pasivo ambiental (pozas de balasto de Petróleos del Perú- Petroperú S.S), 21 botaderos de residuos sólidos, ocho tuberías en disposición inadecuada, cuatro lagunas de oxidación y dos pozas sépticas.
También se identificaron 21 botaderos de residuos sólidos a lo largo de la bahía de Sechura, para ello se realizó el recorrido en las localidades de Puerto Rico (8), varadero de Parachique (1), Playa Blanca (1), caleta Las Delicias (2), caleta Constante (2), caleta de Matacaballo (1), estuarios de Virilla (1), manglar de Chulliyachi (1), playa de Chulliyachi (1), manglar de San Pedro (1), playa San Pedro (1), entre otros más, los que afectan la calidad de agua de la Bahía de Sechura.